《真空饲育箱》讲述一个荒废的世界上最后的人类少女「托莉可」与照顾她的机械人的故事。玩家将会扮演机器人在自动生成的迷宫中寻找食物、治疗疾病的药物材料等，冒求在这个残酷的世界中照顾少女求生。
本作为一款由之前曾担任《萝洁与黄昏古城》《htoL#NiQ 萤火虫日记》等人气作游戏总监与角色设计的「古谷优幸」全新开发制作、「杉江一」负责音乐的迷宫探索型Roguelike RPG，故事背景描述在文明灭亡的数百年后，一个机器人在废金属工厂醒来，并意外发现头上与左眼都被菌丝寄生的人类少女「托莉可」。由于人类无法在这个被有毒的菌类占领的世界生存，因此机器人必须制作出隔离的空间环境，才能让少女继续生存下去
在本作中，玩家们将以少女生存的隔离室作为据点，前往外面的废墟迷宫进行探索收集各种资源，寻找食物、治疗疾病的药物材料等维持少女的生命。玩家们也可以利用收集来的素材在隔离室里配置家具与种植植物，让自己的隔离室变得更加活泼有活力。但玩家们要注意的是，少女也有可能会因为菌类而生病，因此如何寻找有效对抗菌类的手段，也是玩家们在帮助少女生存时不可或缺的重要关键。